Die Organe der Tierärztekammer Schleswig-Holstein sind der Vorstand (z.Zt. bestehend aus Präsidentin, Vizepräsident und vier weiteren Vorstandsmitgliedern) und die Kammerversammlung (z.Zt. 51 Mitglieder). Der Vorstand führt die Geschäfte der Kammer, seine Sitzungen sind nicht öffentlich. Die Kammerversammlung beschließt über alle Angelegenheiten der Kammer von allgemeiner Bedeutung, alle Kammermitglieder sind berechtigt, an den Sitzungen der Kammerversammlung teilzunehmen. Die Kammerversammlung wählt gesetzliche und beratende Ausschüsse, welche die von der Kammerversammlung oder durch den Vorstand übertragene Aufgaben erledigen. Die Ausschusssitzungen sind nicht öffentlich.